シグナル伝達解析の作法 パスウェイ解析とウェットをつなぐ実験法事典
宮澤 恵二 / 井上 純一郎 · 羊土社
「アクセプトされる論文には、作法がある。」--そうは言っても、研究の進展に伴い専門外の領域にチャレンジする時など、その「作法」を知るのは容易ではありません。特にオミクス解析が身近になったいま、興味のある生命現象や疾患に「◯◯パスウェイが関与しているかも」と閃きを得て、慣れない検証を進める場面も増えました。本書はそんな挑戦者に道を拓く、無駄のない、それでいて慎重な研究の組み立て方を、パスウェイごとに専門家が解説。転ばぬ先の杖、実験前の「作法」です。 【目次】 序 1 増殖・分化制御系 1 RTK自己リン酸化 2 RAS - MAPキナーゼ ∗ 3 PI3K- Akt - mTOR ∗ 4 TGF-β - Smad ∗ 5 BMP - Smad 6 Hippo -YAP/ TAZ 2 免疫・炎症応答系 1 NF-κB ∗ 2 JAK ー STAT ∗ 3 TLR - MyD88 4 Inflammasome 5 cGAS ー STING 6 Semaphorin 3 代謝制御系 1 mTORC1 2 AMPK 3 PPAR 4 NAD - サーチュイン 4 ストレス応答系 1 JNK /p38 2 KEAP1 - NRF2 ∗ 3 小胞体ストレス応答 ∗ 4 HIF ∗ 5 p53 ∗ 6 DNA損傷・DNA複製ストレス応答(ATM- Chk2/ATR- Chk1) ∗ 7 DNA損傷(PARP) ∗ 5 細胞運動・形態制御系 1 Src 2 Rho - ROCK 3 インテグリン - FAK 6 ホルモン・神経系 1 cAMP-PKA 2 PLC-IP3 /Ca2+・DAG-PKC 3 Ca2+- Calmodulin -CaMK2 4 NO - cGMP 5 PIEZO 6 TRP 7 Estrogen /Androgen ∗ 7 幹細胞・運命決定系 1 Wnt-β-catenin ∗ 2 Notch ∗ 3 Hedgehog ∗ 8 細胞周期・細胞死制御系 1 RB-E2F ∗ 2 アポトーシス ∗ 3 ネクロプトーシス 4 パイロトーシス 5 フェロトーシス 6 細胞老化 9 その他の細胞応答系 1 ユビキチン・プロテアソーム系 2 オートファジー 3 EMT ∗ 4 Angiogenesis ∗ Key Molecule Index ∗MSigDBのhallmark gene setに含まれる項目
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